Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gtpbp6Q3U6U5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtpbp6Q3U6U5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gtpbp6Q3U6U5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gtpbp6Q3U6U5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Gtpbp6Q3U6U5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtpbp6Q3U6U5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtpbp6Q3U6U5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtpbp6Q3U6U5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Gtpbp6Q3U6U5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Gtpbp6Q3U6U5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gtpbp6Q3U6U5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gtpbp6Q3U6U5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Gtpbp6Q3U6U5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Gtpbp6Q3U6U5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtpbp6Q3U6U5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gtpbp6Q3U6U5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Gtpbp6Q3U6U5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtpbp6Q3U6U5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
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