Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
VwceQ3U515 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
VwceQ3U515 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
VwceQ3U515 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
VwceQ3U515 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
VwceQ3U515 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
VwceQ3U515 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
VwceQ3U515 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
VwceQ3U515 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
VwceQ3U515 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
VwceQ3U515 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
VwceQ3U515 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
VwceQ3U515 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
VwceQ3U515 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
VwceQ3U515 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
VwceQ3U515 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
VwceQ3U515 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
VwceQ3U515 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
VwceQ3U515 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
VwceQ3U515 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,31■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
VwceQ3U515 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,25■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,22■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,21■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
VwceQ3U515 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
VwceQ3U515 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,14■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,14■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24,13■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,13■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,09■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
VwceQ3U515 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,07■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,07■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,04■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
VwceQ3U515 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23,99■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,97■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23,96■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
VwceQ3U515 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
VwceQ3U515 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
VwceQ3U515 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,6 ms