Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhl21Q3U410 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl21Q3U410 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl21Q3U410 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl21Q3U410 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl21Q3U410 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhl21Q3U410 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klhl21Q3U410 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl21Q3U410 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl21Q3U410 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms