Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smyd5Q3TYX3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smyd5Q3TYX3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smyd5Q3TYX3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smyd5Q3TYX3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smyd5Q3TYX3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smyd5Q3TYX3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smyd5Q3TYX3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smyd5Q3TYX3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smyd5Q3TYX3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smyd5Q3TYX3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smyd5Q3TYX3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smyd5Q3TYX3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smyd5Q3TYX3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smyd5Q3TYX3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smyd5Q3TYX3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smyd5Q3TYX3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Smyd5Q3TYX3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smyd5Q3TYX3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smyd5Q3TYX3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smyd5Q3TYX3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smyd5Q3TYX3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smyd5Q3TYX3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smyd5Q3TYX3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smyd5Q3TYX3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Smyd5Q3TYX3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smyd5Q3TYX3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smyd5Q3TYX3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smyd5Q3TYX3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smyd5Q3TYX3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms