Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt2Q3TTY5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt2Q3TTY5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt2Q3TTY5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt2Q3TTY5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt2Q3TTY5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt2Q3TTY5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt2Q3TTY5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt2Q3TTY5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt2Q3TTY5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms