Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdpgp1Q3TLS3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdpgp1Q3TLS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdpgp1Q3TLS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gdpgp1Q3TLS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpgp1Q3TLS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpgp1Q3TLS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpgp1Q3TLS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpgp1Q3TLS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpgp1Q3TLS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gdpgp1Q3TLS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms