Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc127Q3TC33 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc127Q3TC33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc127Q3TC33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc127Q3TC33 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc127Q3TC33 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc127Q3TC33 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc127Q3TC33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc127Q3TC33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc127Q3TC33 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc127Q3TC33 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc127Q3TC33 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc127Q3TC33 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc127Q3TC33 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc127Q3TC33 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc127Q3TC33 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc127Q3TC33 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc127Q3TC33 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc127Q3TC33 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms