Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cnnm3Q32NY4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cnnm3Q32NY4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cnnm3Q32NY4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnnm3Q32NY4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cnnm3Q32NY4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cnnm3Q32NY4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnnm3Q32NY4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cnnm3Q32NY4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cnnm3Q32NY4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cnnm3Q32NY4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cnnm3Q32NY4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnnm3Q32NY4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cnnm3Q32NY4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cnnm3Q32NY4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cnnm3Q32NY4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnnm3Q32NY4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnnm3Q32NY4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnnm3Q32NY4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cnnm3Q32NY4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnnm3Q32NY4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cnnm3Q32NY4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnnm3Q32NY4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cnnm3Q32NY4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnnm3Q32NY4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnnm3Q32NY4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cnnm3Q32NY4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cnnm3Q32NY4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cnnm3Q32NY4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cnnm3Q32NY4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms