Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Treml2Q2LA85 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Treml2Q2LA85 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Treml2Q2LA85 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Treml2Q2LA85 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Treml2Q2LA85 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Treml2Q2LA85 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Treml2Q2LA85 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Treml2Q2LA85 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Treml2Q2LA85 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms