Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpne9Q1RLL3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpne9Q1RLL3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne9Q1RLL3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpne9Q1RLL3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpne9Q1RLL3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpne9Q1RLL3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpne9Q1RLL3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpne9Q1RLL3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpne9Q1RLL3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne9Q1RLL3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne9Q1RLL3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne9Q1RLL3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpne9Q1RLL3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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