Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ptchd1Q14B62 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ptchd1Q14B62 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ptchd1Q14B62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ptchd1Q14B62 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ptchd1Q14B62 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ptchd1Q14B62 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ptchd1Q14B62 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ptchd1Q14B62 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ptchd1Q14B62 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ptchd1Q14B62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ptchd1Q14B62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ptchd1Q14B62 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ptchd1Q14B62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ptchd1Q14B62 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ptchd1Q14B62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ptchd1Q14B62 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ptchd1Q14B62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ptchd1Q14B62 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ptchd1Q14B62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ptchd1Q14B62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ptchd1Q14B62 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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