Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmem52bQ0VBF2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem52bQ0VBF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem52bQ0VBF2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem52bQ0VBF2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem52bQ0VBF2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem52bQ0VBF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem52bQ0VBF2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem52bQ0VBF2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmem52bQ0VBF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem52bQ0VBF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem52bQ0VBF2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem52bQ0VBF2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms