Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 218.18■□□□□ 0.54e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.494e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 217.06■□□□□ 0.324e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 416.97■□□□□ 0.314e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 416.89■□□□□ 0.294e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-207ENST00000577932 572 ntTSL 216.84■□□□□ 0.294e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.194e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 216.02■□□□□ 0.154e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)15.99■□□□□ 0.154e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 415.6■□□□□ 0.094e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.054e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-206ENST00000508982 838 ntTSL 211.16□□□□□ -0.624e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 210.04□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-213ENST00000515447 580 ntTSL 48.86□□□□□ -0.994e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-207ENST00000510930 2019 ntTSL 28.85□□□□□ -0.994e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-203ENST00000503435 592 ntTSL 48.83□□□□□ -14e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.214e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-209ENST00000511908 1981 ntTSL 26.93□□□□□ -1.34e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.484e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-10■■■■■ 31.5
SRSF1Q07955 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.225e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-202ENST00000339290 3365 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.225e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.35e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.345e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-214ENST00000525477 3431 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.345e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-210ENST00000463282 3422 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.355e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-237ENST00000533837 3492 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.375e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.45e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.45e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-204ENST00000367812 3565 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.425e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.935e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-231ENST00000531634 1824 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.335e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-216ENST00000525940 1838 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.335e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-225ENST00000528345 1973 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.385e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-227ENST00000529262 2427 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.395e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-232ENST00000531737 2436 ntTSL 1 (best)6.31□□□□□ -1.45e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-234ENST00000533384 2521 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.525e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-223ENST00000528140 2021 ntTSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.535e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-236ENST00000533808 3349 ntTSL 1 (best)5.38□□□□□ -1.555e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-211ENST00000524588 1630 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.565e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-218ENST00000526320 3081 ntTSL 1 (best)5.29□□□□□ -1.565e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-224ENST00000528343 2091 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.565e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-219ENST00000526565 2399 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.575e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-207ENST00000430686 1036 ntTSL 55.2□□□□□ -1.585e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-233ENST00000531845 3230 ntTSL 24.69□□□□□ -1.665e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-212ENST00000525002 2182 ntTSL 1 (best)4.68□□□□□ -1.665e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-217ENST00000526187 2192 ntTSL 1 (best)4.68□□□□□ -1.665e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.695e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.715e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-215ENST00000525514 3288 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.775e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.775e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-220ENST00000526889 3157 ntTSL 1 (best)3.67□□□□□ -1.825e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-229ENST00000529586 3203 ntTSL 1 (best)3.66□□□□□ -1.825e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-222ENST00000528015 2201 ntTSL 1 (best)3.58□□□□□ -1.845e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-208ENST00000438901 3481 ntTSL 1 (best)3.53□□□□□ -1.845e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 MYB-230ENST00000531519 2911 ntTSL 1 (best)3.32□□□□□ -1.885e-17■■■■■ 31.4
SRSF1Q07955 NUP50-AS1-202ENST00000432502 596 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 31.3
SRSF1Q07955 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 31.3
SRSF1Q07955 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.011e-48■■■■■ 31.2
SRSF1Q07955 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 31
SRSF1Q07955 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-8■■■■■ 31
SRSF1Q07955 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 31
SRSF1Q07955 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.526e-8■■■■■ 31
SRSF1Q07955 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.716e-8■■■■■ 31
SRSF1Q07955 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.842e-48■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)21.77■■□□□ 1.089e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 SAFB2-203ENST00000587802 583 ntTSL 320.68■□□□□ 0.99e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)19.76■□□□□ 0.759e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.429e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.419e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 216.65■□□□□ 0.269e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 216.35■□□□□ 0.219e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.149e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.069e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-207ENST00000443626 776 ntTSL 514.04□□□□□ -0.169e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-202ENST00000323594 739 ntTSL 511.26□□□□□ -0.619e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.689e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-212ENST00000485344 4509 ntTSL 29.88□□□□□ -0.839e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 59.52□□□□□ -0.899e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-217ENST00000511716 562 ntTSL 39.52□□□□□ -0.899e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-211ENST00000476216 817 ntTSL 29.28□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-208ENST00000444548 621 ntTSL 38.1□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.169e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 53.11□□□□□ -1.919e-9■■■■■ 30.9
SRSF1Q07955 THOP1-208ENST00000587468 671 ntTSL 217.36■□□□□ 0.378e-12■■■■■ 30.8
SRSF1Q07955 THOP1-211ENST00000590970 1104 ntTSL 316.66■□□□□ 0.268e-12■■■■■ 30.8
SRSF1Q07955 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.158e-12■■■■■ 30.8
SRSF1Q07955 THOP1-207ENST00000587401 702 ntTSL 212.92□□□□□ -0.348e-12■■■■■ 30.8
SRSF1Q07955 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.949e-11■■■■■ 30.7
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 999.1 ms