Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Caprin2Q05A80 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Caprin2Q05A80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Caprin2Q05A80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Caprin2Q05A80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Caprin2Q05A80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Caprin2Q05A80 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caprin2Q05A80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caprin2Q05A80 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Caprin2Q05A80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Caprin2Q05A80 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Caprin2Q05A80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Caprin2Q05A80 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Caprin2Q05A80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Caprin2Q05A80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Caprin2Q05A80 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Caprin2Q05A80 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Caprin2Q05A80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Caprin2Q05A80 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Caprin2Q05A80 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Caprin2Q05A80 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Caprin2Q05A80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Caprin2Q05A80 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms