Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Sox10Q04888 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Sox10Q04888 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Sox10Q04888 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Sox10Q04888 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Sox10Q04888 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Sox10Q04888 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Sox10Q04888 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Sox10Q04888 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Sox10Q04888 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Sox10Q04888 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Sox10Q04888 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Sox10Q04888 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Sox10Q04888 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Sox10Q04888 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Sox10Q04888 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Sox10Q04888 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Sox10Q04888 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Sox10Q04888 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Sox10Q04888 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Sox10Q04888 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Sox10Q04888 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Sox10Q04888 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Sox10Q04888 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Sox10Q04888 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Sox10Q04888 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Sox10Q04888 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Sox10Q04888 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Sox10Q04888 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Sox10Q04888 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Sox10Q04888 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Sox10Q04888 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Sox10Q04888 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Sox10Q04888 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Sox10Q04888 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sox10Q04888 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Sox10Q04888 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Sox10Q04888 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Sox10Q04888 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Sox10Q04888 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Sox10Q04888 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Sox10Q04888 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Sox10Q04888 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Sox10Q04888 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Sox10Q04888 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Sox10Q04888 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Sox10Q04888 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Sox10Q04888 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Sox10Q04888 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Sox10Q04888 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Sox10Q04888 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Sox10Q04888 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Sox10Q04888 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Sox10Q04888 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Sox10Q04888 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Sox10Q04888 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,6 ms