Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarcad1Q04692 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smarcad1Q04692 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarcad1Q04692 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarcad1Q04692 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarcad1Q04692 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smarcad1Q04692 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Smarcad1Q04692 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smarcad1Q04692 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smarcad1Q04692 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Smarcad1Q04692 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarcad1Q04692 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarcad1Q04692 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarcad1Q04692 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarcad1Q04692 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms