Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GscQ02591 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GscQ02591 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GscQ02591 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GscQ02591 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GscQ02591 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GscQ02591 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GscQ02591 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GscQ02591 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GscQ02591 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GscQ02591 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GscQ02591 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GscQ02591 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GscQ02591 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GscQ02591 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GscQ02591 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GscQ02591 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GscQ02591 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GscQ02591 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GscQ02591 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GscQ02591 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GscQ02591 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GscQ02591 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GscQ02591 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GscQ02591 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GscQ02591 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GscQ02591 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GscQ02591 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GscQ02591 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GscQ02591 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GscQ02591 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GscQ02591 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GscQ02591 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GscQ02591 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GscQ02591 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GscQ02591 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GscQ02591 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GscQ02591 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GscQ02591 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GscQ02591 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GscQ02591 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GscQ02591 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GscQ02591 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GscQ02591 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GscQ02591 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GscQ02591 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GscQ02591 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GscQ02591 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GscQ02591 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GscQ02591 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GscQ02591 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GscQ02591 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GscQ02591 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GscQ02591 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GscQ02591 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GscQ02591 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GscQ02591 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GscQ02591 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GscQ02591 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GscQ02591 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GscQ02591 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GscQ02591 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GscQ02591 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GscQ02591 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GscQ02591 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GscQ02591 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GscQ02591 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GscQ02591 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GscQ02591 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GscQ02591 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GscQ02591 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GscQ02591 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GscQ02591 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GscQ02591 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GscQ02591 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GscQ02591 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GscQ02591 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GscQ02591 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GscQ02591 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GscQ02591 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GscQ02591 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GscQ02591 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GscQ02591 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GscQ02591 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GscQ02591 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GscQ02591 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GscQ02591 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GscQ02591 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GscQ02591 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GscQ02591 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GscQ02591 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GscQ02591 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GscQ02591 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GscQ02591 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GscQ02591 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GscQ02591 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GscQ02591 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GscQ02591 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GscQ02591 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GscQ02591 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms