Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aqp1Q02013 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aqp1Q02013 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aqp1Q02013 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aqp1Q02013 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Aqp1Q02013 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aqp1Q02013 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Aqp1Q02013 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms