Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RykQ01887 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RykQ01887 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RykQ01887 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RykQ01887 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RykQ01887 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RykQ01887 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RykQ01887 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RykQ01887 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RykQ01887 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RykQ01887 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RykQ01887 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RykQ01887 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RykQ01887 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RykQ01887 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RykQ01887 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RykQ01887 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RykQ01887 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RykQ01887 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RykQ01887 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RykQ01887 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RykQ01887 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RykQ01887 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RykQ01887 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RykQ01887 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RykQ01887 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RykQ01887 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RykQ01887 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RykQ01887 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RykQ01887 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RykQ01887 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RykQ01887 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RykQ01887 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RykQ01887 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RykQ01887 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RykQ01887 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RykQ01887 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RykQ01887 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RykQ01887 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RykQ01887 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RykQ01887 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RykQ01887 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RykQ01887 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RykQ01887 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RykQ01887 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RykQ01887 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RykQ01887 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RykQ01887 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RykQ01887 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RykQ01887 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RykQ01887 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RykQ01887 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RykQ01887 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RykQ01887 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RykQ01887 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RykQ01887 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RykQ01887 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RykQ01887 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RykQ01887 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RykQ01887 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RykQ01887 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RykQ01887 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RykQ01887 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RykQ01887 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RykQ01887 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RykQ01887 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RykQ01887 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RykQ01887 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RykQ01887 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RykQ01887 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RykQ01887 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RykQ01887 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RykQ01887 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RykQ01887 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RykQ01887 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RykQ01887 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RykQ01887 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RykQ01887 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RykQ01887 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RykQ01887 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RykQ01887 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RykQ01887 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RykQ01887 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RykQ01887 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RykQ01887 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RykQ01887 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RykQ01887 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RykQ01887 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RykQ01887 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RykQ01887 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RykQ01887 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RykQ01887 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RykQ01887 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RykQ01887 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RykQ01887 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RykQ01887 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RykQ01887 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RykQ01887 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RykQ01887 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RykQ01887 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms