Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Col1a2Q01149 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Col1a2Q01149 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Col1a2Q01149 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Col1a2Q01149 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Col1a2Q01149 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Col1a2Q01149 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Col1a2Q01149 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Col1a2Q01149 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Col1a2Q01149 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Col1a2Q01149 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Col1a2Q01149 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Col1a2Q01149 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Col1a2Q01149 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Col1a2Q01149 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Col1a2Q01149 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Col1a2Q01149 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Col1a2Q01149 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Col1a2Q01149 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col1a2Q01149 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Col1a2Q01149 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Col1a2Q01149 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Col1a2Q01149 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Col1a2Q01149 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col1a2Q01149 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col1a2Q01149 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Col1a2Q01149 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Col1a2Q01149 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col1a2Q01149 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Col1a2Q01149 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Col1a2Q01149 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col1a2Q01149 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col1a2Q01149 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col1a2Q01149 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col1a2Q01149 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms