Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brca2P97929 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brca2P97929 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brca2P97929 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brca2P97929 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brca2P97929 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brca2P97929 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brca2P97929 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brca2P97929 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brca2P97929 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brca2P97929 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brca2P97929 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brca2P97929 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brca2P97929 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brca2P97929 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brca2P97929 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca2P97929 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Brca2P97929 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brca2P97929 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brca2P97929 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brca2P97929 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brca2P97929 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Brca2P97929 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brca2P97929 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Brca2P97929 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brca2P97929 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brca2P97929 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brca2P97929 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brca2P97929 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca2P97929 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca2P97929 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca2P97929 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca2P97929 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brca2P97929 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Brca2P97929 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brca2P97929 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brca2P97929 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brca2P97929 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brca2P97929 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca2P97929 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Brca2P97929 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brca2P97929 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brca2P97929 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Brca2P97929 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca2P97929 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca2P97929 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brca2P97929 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca2P97929 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca2P97929 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brca2P97929 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca2P97929 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca2P97929 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brca2P97929 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brca2P97929 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms