Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npas2P97460 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Npas2P97460 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npas2P97460 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Npas2P97460 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npas2P97460 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Npas2P97460 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Npas2P97460 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Npas2P97460 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npas2P97460 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npas2P97460 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npas2P97460 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npas2P97460 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npas2P97460 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npas2P97460 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npas2P97460 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npas2P97460 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npas2P97460 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npas2P97460 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Npas2P97460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Npas2P97460 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npas2P97460 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Npas2P97460 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npas2P97460 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Npas2P97460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npas2P97460 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npas2P97460 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npas2P97460 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npas2P97460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npas2P97460 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npas2P97460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npas2P97460 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npas2P97460 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Npas2P97460 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npas2P97460 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Npas2P97460 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms