Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbx1P82976 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbx1P82976 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbx1P82976 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gbx1P82976 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbx1P82976 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbx1P82976 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbx1P82976 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbx1P82976 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gbx1P82976 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbx1P82976 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbx1P82976 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms