Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Irx3P81067 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Irx3P81067 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Irx3P81067 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Irx3P81067 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Irx3P81067 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Irx3P81067 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Irx3P81067 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Irx3P81067 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Irx3P81067 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Irx3P81067 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Irx3P81067 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Irx3P81067 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Irx3P81067 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Irx3P81067 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Irx3P81067 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Irx3P81067 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Irx3P81067 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Irx3P81067 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Irx3P81067 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Irx3P81067 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irx3P81067 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irx3P81067 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irx3P81067 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irx3P81067 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Irx3P81067 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Irx3P81067 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Irx3P81067 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Irx3P81067 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Irx3P81067 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Irx3P81067 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Irx3P81067 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Irx3P81067 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Irx3P81067 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Irx3P81067 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Irx3P81067 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Irx3P81067 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Irx3P81067 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Irx3P81067 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Irx3P81067 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Irx3P81067 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Irx3P81067 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Irx3P81067 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Irx3P81067 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Irx3P81067 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Irx3P81067 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Irx3P81067 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Irx3P81067 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Irx3P81067 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Irx3P81067 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Irx3P81067 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Irx3P81067 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Irx3P81067 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Irx3P81067 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Irx3P81067 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Irx3P81067 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Irx3P81067 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Irx3P81067 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Irx3P81067 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irx3P81067 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irx3P81067 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Irx3P81067 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Irx3P81067 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Irx3P81067 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Irx3P81067 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Irx3P81067 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms