Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptprn2P80560 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptprn2P80560 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ptprn2P80560 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptprn2P80560 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptprn2P80560 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ptprn2P80560 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ptprn2P80560 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ptprn2P80560 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ptprn2P80560 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptprn2P80560 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptprn2P80560 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptprn2P80560 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptprn2P80560 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptprn2P80560 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptprn2P80560 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptprn2P80560 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptprn2P80560 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptprn2P80560 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptprn2P80560 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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