Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cct5P80316 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cct5P80316 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cct5P80316 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cct5P80316 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cct5P80316 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cct5P80316 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cct5P80316 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cct5P80316 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cct5P80316 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cct5P80316 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct5P80316 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct5P80316 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cct5P80316 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cct5P80316 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cct5P80316 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cct5P80316 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cct5P80316 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cct5P80316 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cct5P80316 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cct5P80316 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms