Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1bP70700 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr1bP70700 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr1bP70700 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1bP70700 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1bP70700 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1bP70700 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1bP70700 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr1bP70700 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1bP70700 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1bP70700 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1bP70700 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1bP70700 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Polr1bP70700 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Polr1bP70700 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Polr1bP70700 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1bP70700 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1bP70700 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Polr1bP70700 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Polr1bP70700 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Polr1bP70700 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr1bP70700 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1bP70700 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr1bP70700 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr1bP70700 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms