Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxcr4P70658 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcr4P70658 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcr4P70658 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcr4P70658 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcr4P70658 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcr4P70658 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcr4P70658 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcr4P70658 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcr4P70658 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcr4P70658 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcr4P70658 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcr4P70658 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcr4P70658 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcr4P70658 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcr4P70658 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcr4P70658 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr4P70658 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cxcr4P70658 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcr4P70658 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms