Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad50P70388 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad50P70388 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rad50P70388 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Rad50P70388 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rad50P70388 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rad50P70388 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rad50P70388 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rad50P70388 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rad50P70388 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rad50P70388 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rad50P70388 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rad50P70388 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rad50P70388 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rad50P70388 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rad50P70388 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rad50P70388 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rad50P70388 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rad50P70388 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rad50P70388 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rad50P70388 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rad50P70388 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rad50P70388 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rad50P70388 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad50P70388 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rad50P70388 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rad50P70388 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rad50P70388 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rad50P70388 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rad50P70388 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rad50P70388 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rad50P70388 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rad50P70388 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rad50P70388 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rad50P70388 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Rad50P70388 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rad50P70388 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rad50P70388 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rad50P70388 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rad50P70388 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rad50P70388 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rad50P70388 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad50P70388 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rad50P70388 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms