Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SbdsP70122 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SbdsP70122 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SbdsP70122 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SbdsP70122 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SbdsP70122 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SbdsP70122 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SbdsP70122 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SbdsP70122 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SbdsP70122 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SbdsP70122 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SbdsP70122 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SbdsP70122 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SbdsP70122 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SbdsP70122 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SbdsP70122 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SbdsP70122 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SbdsP70122 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SbdsP70122 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SbdsP70122 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SbdsP70122 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SbdsP70122 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SbdsP70122 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SbdsP70122 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SbdsP70122 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms