Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntn5P68500 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntn5P68500 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntn5P68500 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntn5P68500 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntn5P68500 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntn5P68500 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntn5P68500 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cntn5P68500 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cntn5P68500 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntn5P68500 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntn5P68500 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cntn5P68500 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cntn5P68500 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cntn5P68500 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cntn5P68500 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cntn5P68500 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cntn5P68500 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntn5P68500 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntn5P68500 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntn5P68500 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntn5P68500 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntn5P68500 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms