Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps27aP62983 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps27aP62983 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps27aP62983 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps27aP62983 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps27aP62983 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps27aP62983 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps27aP62983 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps27aP62983 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps27aP62983 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps27aP62983 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps27aP62983 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps27aP62983 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps27aP62983 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps27aP62983 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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