Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabra1P62812 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabra1P62812 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gabra1P62812 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gabra1P62812 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gabra1P62812 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gabra1P62812 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gabra1P62812 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gabra1P62812 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabra1P62812 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms