Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl18aP62717 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl18aP62717 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl18aP62717 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl18aP62717 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl18aP62717 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl18aP62717 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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