Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps11P62281 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps11P62281 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps11P62281 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps11P62281 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps11P62281 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps11P62281 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps11P62281 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps11P62281 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps11P62281 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps11P62281 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps11P62281 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps11P62281 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps11P62281 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps11P62281 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps11P62281 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps11P62281 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps11P62281 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps11P62281 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps11P62281 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps11P62281 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps11P62281 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps11P62281 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps11P62281 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms