Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms