Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ppfia3P60469 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppfia3P60469 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ppfia3P60469 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ppfia3P60469 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppfia3P60469 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppfia3P60469 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppfia3P60469 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppfia3P60469 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppfia3P60469 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppfia3P60469 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppfia3P60469 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppfia3P60469 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppfia3P60469 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppfia3P60469 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppfia3P60469 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ppfia3P60469 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppfia3P60469 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppfia3P60469 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppfia3P60469 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppfia3P60469 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppfia3P60469 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppfia3P60469 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppfia3P60469 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppfia3P60469 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppfia3P60469 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppfia3P60469 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppfia3P60469 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms