Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpm1P58771 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm1P58771 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tpm1P58771 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpm1P58771 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpm1P58771 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm1P58771 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpm1P58771 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpm1P58771 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpm1P58771 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm1P58771 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpm1P58771 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpm1P58771 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpm1P58771 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm1P58771 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm1P58771 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpm1P58771 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpm1P58771 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tpm1P58771 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpm1P58771 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Tpm1P58771 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpm1P58771 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpm1P58771 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm1P58771 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm1P58771 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpm1P58771 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm1P58771 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm1P58771 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpm1P58771 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpm1P58771 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm1P58771 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm1P58771 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm1P58771 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm1P58771 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tpm1P58771 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tpm1P58771 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tpm1P58771 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm1P58771 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm1P58771 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tpm1P58771 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm1P58771 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm1P58771 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tpm1P58771 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms