Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Samsn1P57725 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Samsn1P57725 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Samsn1P57725 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Samsn1P57725 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Samsn1P57725 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Samsn1P57725 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Samsn1P57725 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Samsn1P57725 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Samsn1P57725 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Samsn1P57725 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Samsn1P57725 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Samsn1P57725 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Samsn1P57725 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Samsn1P57725 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Samsn1P57725 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Samsn1P57725 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Samsn1P57725 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,1 ms