Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp5eP56382 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp5eP56382 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atp5eP56382 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5eP56382 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5eP56382 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms