Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PltpP55065 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PltpP55065 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PltpP55065 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PltpP55065 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PltpP55065 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PltpP55065 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PltpP55065 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PltpP55065 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PltpP55065 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PltpP55065 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PltpP55065 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PltpP55065 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PltpP55065 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PltpP55065 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PltpP55065 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PltpP55065 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PltpP55065 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PltpP55065 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PltpP55065 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PltpP55065 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PltpP55065 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PltpP55065 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PltpP55065 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PltpP55065 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PltpP55065 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PltpP55065 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PltpP55065 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PltpP55065 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PltpP55065 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PltpP55065 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PltpP55065 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PltpP55065 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PltpP55065 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PltpP55065 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PltpP55065 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PltpP55065 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PltpP55065 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PltpP55065 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PltpP55065 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PltpP55065 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PltpP55065 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PltpP55065 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PltpP55065 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PltpP55065 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PltpP55065 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PltpP55065 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PltpP55065 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PltpP55065 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PltpP55065 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PltpP55065 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PltpP55065 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PltpP55065 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PltpP55065 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PltpP55065 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PltpP55065 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PltpP55065 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PltpP55065 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PltpP55065 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PltpP55065 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PltpP55065 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PltpP55065 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PltpP55065 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PltpP55065 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PltpP55065 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PltpP55065 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PltpP55065 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PltpP55065 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PltpP55065 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PltpP55065 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PltpP55065 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PltpP55065 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PltpP55065 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PltpP55065 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PltpP55065 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PltpP55065 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PltpP55065 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PltpP55065 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PltpP55065 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PltpP55065 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PltpP55065 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PltpP55065 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PltpP55065 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PltpP55065 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PltpP55065 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PltpP55065 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PltpP55065 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PltpP55065 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PltpP55065 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PltpP55065 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PltpP55065 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PltpP55065 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PltpP55065 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PltpP55065 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PltpP55065 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PltpP55065 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PltpP55065 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PltpP55065 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PltpP55065 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PltpP55065 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms