Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Faf1P54731 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Faf1P54731 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Faf1P54731 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Faf1P54731 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Faf1P54731 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Faf1P54731 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Faf1P54731 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Faf1P54731 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Faf1P54731 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Faf1P54731 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Faf1P54731 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Faf1P54731 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Faf1P54731 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Faf1P54731 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms