Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
StomP54116 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StomP54116 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
StomP54116 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StomP54116 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StomP54116 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StomP54116 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StomP54116 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StomP54116 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StomP54116 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
StomP54116 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StomP54116 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StomP54116 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StomP54116 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
StomP54116 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StomP54116 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StomP54116 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StomP54116 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StomP54116 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StomP54116 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
StomP54116 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StomP54116 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StomP54116 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StomP54116 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
StomP54116 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
StomP54116 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StomP54116 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StomP54116 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
StomP54116 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
StomP54116 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StomP54116 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StomP54116 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
StomP54116 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StomP54116 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StomP54116 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
StomP54116 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
StomP54116 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
StomP54116 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
StomP54116 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
StomP54116 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
StomP54116 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StomP54116 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
StomP54116 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
StomP54116 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
StomP54116 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StomP54116 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
StomP54116 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StomP54116 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StomP54116 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StomP54116 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StomP54116 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StomP54116 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
StomP54116 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
StomP54116 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StomP54116 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StomP54116 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
StomP54116 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StomP54116 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.29■■□□□ 1
StomP54116 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StomP54116 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StomP54116 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
StomP54116 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StomP54116 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StomP54116 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StomP54116 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
StomP54116 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StomP54116 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StomP54116 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StomP54116 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
StomP54116 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
StomP54116 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
StomP54116 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
StomP54116 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StomP54116 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StomP54116 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StomP54116 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
StomP54116 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
StomP54116 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
StomP54116 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StomP54116 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StomP54116 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StomP54116 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StomP54116 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StomP54116 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StomP54116 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StomP54116 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
StomP54116 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StomP54116 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StomP54116 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StomP54116 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
StomP54116 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
StomP54116 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
StomP54116 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StomP54116 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StomP54116 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StomP54116 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StomP54116 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
StomP54116 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
StomP54116 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
StomP54116 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203 ms