Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc16a1P53986 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc16a1P53986 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc16a1P53986 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc16a1P53986 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc16a1P53986 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc16a1P53986 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc16a1P53986 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc16a1P53986 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc16a1P53986 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc16a1P53986 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc16a1P53986 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc16a1P53986 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc16a1P53986 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc16a1P53986 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc16a1P53986 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc16a1P53986 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc16a1P53986 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc16a1P53986 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc16a1P53986 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms