Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Defa11P50709 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa11P50709 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa11P50709 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Defa11P50709 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa11P50709 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa11P50709 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa11P50709 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa11P50709 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Defa11P50709 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa11P50709 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa11P50709 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa11P50709 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa11P50709 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa11P50709 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa11P50709 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms