Protein–RNA interactions for Protein: P50518

Atp6v1e1, V-type proton ATPase subunit E 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e1P50518 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6v1e1P50518 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6v1e1P50518 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6v1e1P50518 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp6v1e1P50518 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp6v1e1P50518 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp6v1e1P50518 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp6v1e1P50518 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp6v1e1P50518 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp6v1e1P50518 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1e1P50518 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e1P50518 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e1P50518 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6v1e1P50518 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp6v1e1P50518 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6v1e1P50518 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms