Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cav1P49817 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cav1P49817 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cav1P49817 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cav1P49817 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cav1P49817 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cav1P49817 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cav1P49817 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cav1P49817 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cav1P49817 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cav1P49817 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cav1P49817 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cav1P49817 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cav1P49817 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cav1P49817 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cav1P49817 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cav1P49817 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cav1P49817 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cav1P49817 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cav1P49817 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms