Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hcls1P49710 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hcls1P49710 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hcls1P49710 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hcls1P49710 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hcls1P49710 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hcls1P49710 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcls1P49710 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hcls1P49710 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hcls1P49710 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcls1P49710 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcls1P49710 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hcls1P49710 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hcls1P49710 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hcls1P49710 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hcls1P49710 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms