Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prox1P48437 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prox1P48437 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prox1P48437 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prox1P48437 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prox1P48437 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prox1P48437 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox1P48437 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox1P48437 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prox1P48437 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prox1P48437 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prox1P48437 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prox1P48437 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prox1P48437 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prox1P48437 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prox1P48437 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms