Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CratP47934 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CratP47934 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CratP47934 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CratP47934 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CratP47934 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CratP47934 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CratP47934 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CratP47934 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CratP47934 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CratP47934 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CratP47934 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CratP47934 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CratP47934 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CratP47934 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CratP47934 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CratP47934 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CratP47934 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CratP47934 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CratP47934 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CratP47934 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CratP47934 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CratP47934 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CratP47934 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CratP47934 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CratP47934 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CratP47934 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CratP47934 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CratP47934 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CratP47934 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CratP47934 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CratP47934 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CratP47934 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CratP47934 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CratP47934 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CratP47934 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CratP47934 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CratP47934 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CratP47934 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CratP47934 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CratP47934 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CratP47934 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CratP47934 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CratP47934 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CratP47934 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CratP47934 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CratP47934 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CratP47934 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CratP47934 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CratP47934 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CratP47934 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CratP47934 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CratP47934 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CratP47934 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CratP47934 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CratP47934 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CratP47934 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CratP47934 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CratP47934 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CratP47934 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CratP47934 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CratP47934 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CratP47934 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CratP47934 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CratP47934 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CratP47934 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CratP47934 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CratP47934 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CratP47934 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CratP47934 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CratP47934 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CratP47934 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CratP47934 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CratP47934 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CratP47934 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CratP47934 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CratP47934 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CratP47934 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CratP47934 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CratP47934 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CratP47934 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CratP47934 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CratP47934 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CratP47934 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CratP47934 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CratP47934 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CratP47934 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CratP47934 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CratP47934 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CratP47934 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CratP47934 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CratP47934 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CratP47934 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CratP47934 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CratP47934 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CratP47934 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CratP47934 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CratP47934 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CratP47934 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CratP47934 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms